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发表于 2006-6-10 19:28:35
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◇靠近效应(proximity effect)
- m a* m% R+ y非酶促反应或酶促反应速率的增加是由于活性部位处反应剂有效浓度增大(底物靠近活性部位)的结果,这将导致更频繁地形成过渡态。; g o" c7 u" Q& i# ?
◇初速度(initial velocity)5 A' K2 \1 i3 r% P5 \
酶促反应最初阶段底物转化为产物的速度,这一阶段产物的浓度非常低,其逆反应可以忽略不计。
0 N+ U8 d, ~1 l( t; n' g3 i◇米氏方程(Michaelis-Menten equation)
# c1 \3 z) c" O: w$ A( q, K表示一个酶促反应的起始速度(v)与底物浓度([S])关系的速度方程,v=Vmax[S]/(Km+[S])。) Z! S7 U2 T: _% j" C0 B' O9 @
◇米氏常数(Michaelis constant,)(Km)2 @8 u0 g' N/ x0 k. ]1 O- W- S
对于一个给定反应,导致酶促反应速度的起始速度(v0)达到最大反应速度(Vmax)一半时的底物浓度。 + n1 ?; D1 [( }; u; J# S
◇催化常数(catalytic number)(Kcat)" l% y. e/ c# l; v1 S9 D
也称之转换数(turnover number)。一个动力学常数,是在底物浓度处于饱和状态下,一个酶(或一个酶活性部位)催化一个反应有多快的测量。催化常数等于最大反应速度除以总的酶浓度(Vmax/[E]total),或者是每摩尔酶活性部位每秒钟转化为产物的底物的摩尔数。
4 I$ e# V1 t) n( g5 l◇双倒数作图(double-reciprocal plot)
& G. f9 U1 C+ g! y) b也称之Lineweaver-Burk作图。一个酶促反应速度的倒数(1/v)对底物浓度的倒数(1/)的作图。X和y轴上的截距分别代表米氏常数(Km)和最大反应速度(Vmax)的倒数。
. B( Y6 x! F, @4 d# e/ l! P, t◇竞争性抑制作用(competitive inhibition): |; H' @0 l3 q/ a. g4 _2 w9 l
通过增加底物浓度可以逆转的一种酶抑制类型。一个竞争性抑制剂通常与正常的底物或配体竞争同一个蛋白质的结合部位。这种抑制使得Km增大,而Vmax不变。. P- ?; y8 ]+ Q; G ~
◇非竞争性抑制作用(noncompetitive inhibition)* e' O0 U* R" u" i
抑制剂不仅与游离酶结合,也可以与酶-底物复合物结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制使得Vmax变小,但Km不变。% e; D- n; c; E; E3 q+ p
◇反竞争性抑制作用(uncompetitive inhibition)" L: @4 Z9 A" m9 u, e
抑制剂只与酶-底物复合物结合,而不与游离酶结合的一种酶促反应抑制作用。这种抑制作用使得Vmax,Km都变小,但Vmax/Km比值不变。
, w; R; Q/ S% I. X, O◇丝氨酸蛋白酶(serine protease)% j0 n8 k/ T! Q+ Q# b4 I( O
活性部位含有在催化期间起着亲核体作用的丝氨酸残基的蛋白酶。# q% C0 z* j: J, S& E" _
◇酶原(zymogen)
, g; P5 z- ~- Z通过有限蛋白水解能够由无活性变成具有催化活性的酶前体。
6 p2 B3 c6 o- Z& U◇调节酶(regulatory enzyme)- M9 @8 L# m! m$ P# ~& j$ ^: F& Q
位于一个或多个代谢途径内的一个关键部位的酶,它的活性根据代谢的需要被增加或降低。9 K+ O% g2 D' _0 z
◇别构酶(allosteric enzyme)
) }9 w% C& J* ?6 T一种其活性受到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。* U8 n R6 [6 k. P1 ~
◇别构调节剂(allosteric modulator)
3 C& o: [1 `4 v7 G结合在别构酶的调节部位调节该酶催化活性的生物分子,别构调节剂可以是激活剂,也可以是抑制剂。
( h. }, T) h( E, |4 K! G◇齐变模式(concerted model)3 F4 ^3 [" U$ m, a8 E
相同配体与寡聚蛋白协同结合的一种模式。按照最简单齐变模式,由于一个底物或别构调节剂的结合,蛋白质的构象在T(对底物亲和性低的构象)和R(对底物亲和性高的构象)之间变换。这一模式提出所有蛋白质的亚基都具有同样的构象,或是T,或是R构象。
9 Y+ C5 }; \* o1 F$ ]% k5 a# A, e◇序变模式(sequential model)5 ?2 f# [7 S+ J3 D* q7 A* q o
相同配体与寡聚蛋白协同结合的另外一种模式。按照最简单的序变模式,一个配体的结合会诱导它结合的亚基的三级结构的变化,以及使相邻亚基的构象发生很大的变化。按照序变模式,只有一个亚基对配体具有高的亲和性。
& d/ c% l6 r9 p: c' y, `: Z◇同功酶(isoenzyme或isozyme)# R7 _3 e% c. }- r0 O- z l r
催化同一化学反应而化学组成不同的一组酶。它们彼此在氨基酸序列、底物的亲和性等方面都存在着差异。" s6 M% X1 Q: h9 g
◇别构调节物(allosteric modulator)
/ M. }: u, B9 D6 y! y( k也称之别构效应物(allosteric effector)。结合在别构酶的调节部位,调节酶催化活性的生物分子。别构调节物可以是激活剂或抑制剂。
2 u0 Q8 p" {# J4 n8 _◇维生素(vitamin)
; n- s; k8 C" `3 H- P" A; n是一类动物本身不能合成但对动物生长和健康又是必需的有机化合物,所以必须从饮食中获得。许多辅酶都是由维生素衍生的。
: I/ x2 y7 T# T. {& Z% i◇水溶性维生素(water-soluble vitamins)
% d/ L+ U! z; K! c2 z1 X" Z一类能溶于水的有机营养分子。其中包括在酶的催化中起着重要作用的B族维生素以及抗坏血酸(维生素C)等。
* ]8 m' C# v% n& F; g8 t" v& F◇脂溶性维生素(lipid vitamins)1 ^1 p0 }& @5 U9 \% d: m( J
由长的碳氢链或稠环组成的聚戊二烯化合物。脂溶性维生素包括维生素A、D、E和K,这类维生素能被动物贮存。
6 X/ M6 u" \* z: u* d◇辅酶(coenzyme)7 q, I6 V: K( j5 t9 \' Y2 G
某些酶在发挥催化作用时所需要的一类辅助因子,其成分中往往含有维生素。! V9 }- I) x" T; {
◇辅基(prosthetic group)
' e2 m% r0 h4 P/ X6 L: ~" c9 Y是与酶蛋白共价结合的金属离子或一类有机化合物,用透析法不能除去。辅基在整个酶促反应过程中始终与酶的特定部位结合。5 q/ N' y- R- @2 ^) \& v
◇尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+,nicotinamide adenine dinucleotide phosphate)2 n/ [ d3 x% R* ?' o
含有尼克酰胺的辅酶,在某些氧化还原反应中起着氢原子和电子载体的作用,常常作为脱氢酶的辅酶。
3 S% Z8 P% Z3 z* Z& K) I◇黄素单核苷酸(FMN, flavin mononucleotide)( d1 W" {8 L1 ]9 w
核黄素磷酸,是某些氧化还原酶的辅酶。9 S* h! y9 r. Q0 Y. V
◇黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD, flavin adenine dinucleotide)/ G* U, x% ^# L& _9 I7 m( B
是某些氧化还原酶的辅酶,含有核黄素。0 b) `/ u) L8 b) s
◇硫胺素焦磷酸(thiamine pyrophosphate)
( z6 j# t5 Y1 l2 l5 w是维生素B1的辅酶形式,参与转醛基反应。
& \9 b5 c2 a/ _( j◇磷酸吡哆醛(pyidoxal phosphate)
) D6 @! a0 ]4 W0 V+ |* |9 N是维生素B6(吡哆醇)的衍生物,是转氨酶、脱羧酶和消旋酶的辅酶。5 I5 S) i( L1 _
◇生物素(biotin)6 F8 ^9 L$ B8 r
参与脱羧反应的一种酶的辅助因子。. P$ T( b# J8 X$ Q3 @! W5 [% d
◇辅酶A(coenzyme A)7 o4 l* c! W. r
一种含有泛酸的辅酶,在某些酶促反应中作为酰基的载体。
( }. M# } J- _- _, g◇类胡萝卜素(carotenoids)
$ B( z8 L- h% [- J( g9 f& {由异戊二烯组成的脂溶性光合色素。9 B9 b2 L7 ?0 Y
◇转氨酶(transaminases)
% Y) z5 s% d4 Y& U5 M) A也称之氨基转移酶(aminotransferases),在该酶的催化下一个α-氨基酸的氨基转可移给另一个
: I% C. j/ J/ x {/ j' y6 }◇醛糖(aldoses)
% l# X9 y+ E; U3 y- c一类单糖,该单糖中氧化数最高的碳原子(指定为C-1)是个醛基。
3 Z. a( u* W1 W, H% H+ P. _. l, F◇酮糖(ketoses)
6 [2 R! z h( b0 t5 Q- W; A一类单糖,该单糖中氧化数最高的碳原子(指定为C-2)是个酮基。
/ l. e9 r* r. c0 A" r$ ?$ @◇异头物(anomers), O- d) p, A- a; } b P
仅在氧化数最高的碳原子(异头碳)具有不同构型的糖分子的两种异构体。9 Y5 ~5 l+ q9 Y( K7 Q# K: k$ F; b) f
◇异头碳(anomeric carbon)
1 M7 q3 I% _5 c一个环化单糖的氧化数最高的碳原子。异头碳具有一个羰基的化学反应性。
" n) Q( ]" K2 a; F6 Z' b◇变旋(mutarotation)+ B9 }4 E6 A3 y, Q" D4 h9 d
一个吡喃糖、呋喃糖或糖苷伴随着它们的α-和β-异构形式的平衡而发生的比旋度变化。
, d* a4 s" S1 ^. g5 ?◇单糖(monosaccharide) M, B0 l; P- c4 o1 m' W
由三个或更多碳原子组成的具有经验公式(CH2O)n的简单糖。
; N0 u" P9 c& x! e1 d◇糖苷(glycosides)- B1 v: `( T" H
单糖半缩醛羟基与另一个分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羟基、胺基或巯基缩合形成的含糖衍生物。
X) e: }( z7 L! `◇糖苷键(glycosidic bond)5 }; M" s8 q1 G7 B% `4 L0 d
一个糖半缩醛羟基与另一个分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羟基、胺基或巯基之间缩合形成的缩醛或缩酮键,常见的糖苷键有O-糖苷键和N-糖苷键。
+ m) C- i' J4 S9 t6 u; A◇寡糖(oligoccharide)
, L4 r9 ^/ }! w0 o5 B) y% `: i由2个~20个单糖残基通过糖苷键连接形成的聚合物。" A& z& {: C# Y1 ~9 o
◇多糖(polysaccharide)
; a9 v- l% J4 t6 V; ?20个以上的单糖通过糖苷键连接形成的聚合物。多糖链可以是线性的或带有分支的。
) B2 w3 t7 F( g9 `" F◇还原糖(reducing sugar)
3 [2 M/ D, P7 B8 W1 c7 u羰基碳(异头碳)没有参与形成糖苷键,因此可被氧化充当还原剂的糖。 - `# w+ y, f2 _2 e# t' [
◇淀粉(starch)2 c2 E# m- E3 C6 h! z3 G ]
一类可作为植物中贮存多糖的葡萄糖残基的同聚物。由两种形式的淀粉:一种是直链淀粉,是没有分支的只是通过α-(1→4)糖苷键连接的葡萄糖残基聚合物。另一种是支链淀粉,是含有分支的α-(1→4)糖苷键连接的葡萄糖残基聚合物,支链在分支点处通过α-(1→6)糖苷键与主链相连。
$ G! I/ {- r; J4 n# t) S. ?◇糖原(glycogen)
1 K2 [1 r" S- Y/ K是含有分支的α-(1→4)糖苷键连接在一起的葡萄糖的同聚物,支链在分支点处通过α-(1→6)糖苷键与主链相连。
/ M. j# Q' l. D9 D◇极限糊精(limit dexitrin)
8 {( E6 E" I' g8 E N C! L |是指支链淀粉中带有支链的核心部分,该部分在支链淀粉经淀粉酶水解作用、糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的进一步降解需要α(1→6)糖苷键的水解。
+ ~2 N) p- _6 M+ u, p◇肽聚糖(peptidoglycan)6 @+ K$ L! a5 e! Z6 l2 e$ `
N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替连接的杂多糖与不同组成的肽交叉连接形成的大分子。肽聚糖是许多细菌细胞壁的主要成分。# }. V% g. _ \6 d8 S1 i: o
◇糖蛋白(glycoprotein), |3 h% |+ W0 t* o% D+ M4 J
含有共价连接的葡萄糖残基的蛋白质。
6 v9 E" |" K" C% s5 ]◇蛋白聚糖(proteoglycans)
: i) i/ W, p& C3 e& }由杂多糖与一个多肽链组成的杂化的大分子,多糖是分子的主要成分。+ W0 ^; m5 |& B+ e: v
◇脂肪酸(fatty acid)
: |/ @3 L \6 i8 U( l7 w i是指一端含有一个羧基的长的脂肪族碳氢链。脂肪酸是最简单的一种脂,它是许多更复杂的脂(例如三脂酰甘油、甘油磷脂、鞘磷脂和蜡)的成分。
& o& x% Y" [9 ]+ |/ Z0 u. g+ I◇饱和脂肪酸(saturated fatty acid) e G% b% g. _+ d
不含有-C=C-双键的脂肪酸。$ v3 g+ b' ?! M( w4 q. z
◇不饱和脂肪酸(unsaturated fatty acid)
7 j# ? H2 P. C9 {至少含有一个-C=C-双键的脂肪酸。+ v; P- O& m4 x1 @: X- O2 A
◇核苷(nucleoside)
) Z8 r1 L3 t+ ^是由嘌呤或嘧啶碱基通过共价键与戊糖连接组成的化合物。核糖与碱基一般都是由糖的异头碳与嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之间形成的β-N-糖苷键连接的。
d' J7 \6 ]1 v' O2 n Z◇核苷酸(nucleotide)! e/ W, o2 R$ Z& ?; g9 e
核苷的戊糖成分中的羟基磷酸化形成的化合物。& x2 Y6 u& G9 d3 N
◇cAMP(cyclic AMP)% B* V! u$ i/ ]+ [; U
3ˊ,5ˊ-环腺苷酸,细胞内的第二信使,由于某些激素或其它分子信号刺激激活腺苷
( K6 f) D$ k' o◇分解代谢反应(catabolic reaction)3 c# ]: i, g$ k: m3 p8 S; r3 k
降解复杂分子为生物体提供小的构件分子和能量的代谢反应。$ r7 y% y" n V; L x+ V# O. C3 A9 |; X5 T' b
◇合成代谢反应(anabolic reaction)
" g: K$ r8 y) O4 s8 U合成用于细胞维持和生长所需要的分子的代谢反应。
+ u( w8 s4 Z' S* f3 G# {7 e◇反馈抑制(feedback inhibition); m4 P5 r7 E" t( [+ @) M7 D! x
催化一个代谢途径中前面反应的酶受到同一途径的终产物抑制的现象。
1 [. L: T0 A$ |" r; N7 o◇前馈激活(feed-forward activation)
; }1 ?8 d4 @$ B+ u1 y8 L代谢途径中一个酶被该途径中前面产生的代谢物激活的现象。; L% F. h( D3 b- X( M, S; A8 r- ?. p
◇标准自由能变化(ΔG°)(standard free-energy change)% }" Z: A ]. G" W
在一系列标准条件(温度:298K;压力:1个大气压;所有溶质的浓度都是1M)下发生的反应的自由能变化。ΔG°ˊ表示pH7.0条件下的标准自由能变化。
W5 m( v, R g0 r* |8 l! U' w% G◇标准还原电位(E°ˊ)(standard reduction potential): `7 a) O" h, ?! d; a5 P" k% o4 x
25℃和pH7.0条件下一个还原剂和它的氧化形式在1M浓度下表现出的电动势。 |
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